Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp1Q62209 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp1Q62209 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp1Q62209 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms