Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3a2Q62203 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms