Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf1Q62187 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttf1Q62187 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ttf1Q62187 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttf1Q62187 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ttf1Q62187 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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