Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim27Q62158 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim27Q62158 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim27Q62158 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms