Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctr9Q62018 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctr9Q62018 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctr9Q62018 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms