Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Odf1Q61999 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Odf1Q61999 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Odf1Q61999 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Odf1Q61999 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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