Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrc1Q61830 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrc1Q61830 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrc1Q61830 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms