Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lama3Q61789 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lama3Q61789 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lama3Q61789 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms