Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itga7Q61738 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga7Q61738 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga7Q61738 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms