Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrxQ61687 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrxQ61687 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms