Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ecm1Q61508 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ecm1Q61508 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms