Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi1Q61474 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msi1Q61474 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msi1Q61474 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms