Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccna1Q61456 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccna1Q61456 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccna1Q61456 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms