Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vsx2Q61412 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms