Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BcanQ61361 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BcanQ61361 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BcanQ61361 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BcanQ61361 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms