Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf9Q61179 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf9Q61179 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf9Q61179 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf9Q61179 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf9Q61179 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf9Q61179 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms