Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4bQ61136 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4bQ61136 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms