Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf3Q60980 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms