Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp7Q60973 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp7Q60973 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms