Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbbp4Q60972 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp4Q60972 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp4Q60972 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms