Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Meis1Q60954 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Meis1Q60954 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms