Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot7Q60809 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot7Q60809 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms