Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf4Q60793 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf4Q60793 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms