Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NfkbibQ60778 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbibQ60778 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms