Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stxbp3Q60770 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms