Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf3Q60765 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf3Q60765 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms