Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sik1Q60670 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sik1Q60670 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sik1Q60670 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms