Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2aQ60648 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms