Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sin3aQ60520 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sin3aQ60520 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sin3aQ60520 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sin3aQ60520 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms