Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp20Q5XG71 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp20Q5XG71 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms