Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf15Q5UBV8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms