Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brip1Q5SXJ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brip1Q5SXJ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms