Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myh1Q5SX40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myh1Q5SX40 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myh1Q5SX40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms