Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CluhQ5SW19 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CluhQ5SW19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CluhQ5SW19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms