Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PfasQ5SUR0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms