Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d1Q5SSN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms