Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zzef1Q5SSH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zzef1Q5SSH7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms