Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930512M02RikQ5SQK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930512M02RikQ5SQK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms