Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf215Q5SPX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf215Q5SPX3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms