Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc85aQ5SP85 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc85aQ5SP85 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms