Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms