Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms