Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trdv4Q5R1A3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms