Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm6bQ5NCY0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm6bQ5NCY0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kdm6bQ5NCY0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms