Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rapgef6Q5NCJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rapgef6Q5NCJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms