Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1810065E05RikQ5NC41 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1810065E05RikQ5NC41 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810065E05RikQ5NC41 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms