Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kctd1Q5M956 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd1Q5M956 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms