Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SynaQ5G5D5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SynaQ5G5D5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SynaQ5G5D5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms