Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ecm2Q5FW85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ecm2Q5FW85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ecm2Q5FW85 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ecm2Q5FW85 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms