Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trpm3Q5F4S9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm3Q5F4S9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms