Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rassf5Q5EBH1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rassf5Q5EBH1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms